כאשר ראש משאבה יישאר ללא שימוש למשך תקופה ממושכת, הליכי אחסון נאותים חיוניים כדי למנוע קורוזיה ונזקים של רכיבים, ובכך להבטיח פעולה תקינה בשימוש לאחר מכן. שיטות האחסון הספציפיות מתוארות להלן.
ראשית, בצע ניקוי יסודי: הסר אבק ופסולת מהמשטח החיצוני של ראש המשאבה. פרק את ראש המשאבה כדי לנקות את כל שאריות הנוזל והמשקעים שהצטברו מהחלל הפנימי, ולאחר מכן נגב את כל המשטחים עם מטלית רכה ונטולת מוך כדי להבטיח שהפנים והחוץ יישארו נקיים ומסודרים, ובכך למנוע קורוזיה פנימית הנגרמת משאריות נוזלים. שנית, יש ליישם אמצעי מניעה של -לחות: אחסן את ראש המשאבה בסביבה יבשה,- מאווררת היטב וקרירה, ולהרחיק אותו מאזורים לחים וממקורות מים. הנחת חומר ייבוש בתוך ראש המשאבה יכולה לסייע בספיגת לחות אטמוספרית ולמנוע קורוזיה של רכיבים כגון מיסבים ואימפלרים.
לאחר מכן, התייחס לדרישות הסיכה והאיטום: מרחו כמות מספקת של שמן סיכה על רכיבים פנימיים-כגון מיסבים וצירים-כדי למנוע קורוזיה והתקלקות. החלף אטמים מזדקנים, וכסה את כל ראש המשאבה בכיסוי אבק כדי למנוע חדירת אבק.
לבסוף, נקטו באמצעי הגנה מתאימים כדי להגן על ראש המשאבה מפני פגיעות או דחיסה, והבטיחו שכל הרכיבים יישארו שלמים. במהלך תקופת האחסון, בדוק מעת לעת את מצב ראש המשאבה; אם מתגלים סימני קורוזיה או נזק, יש לטפל בהם מיד.
